根据搜索结果，上海拥有软件工程专业的院校主要包括以下几类：

一、重点综合性大学

复旦大学

- 计算机科学与技术学院与计算机工程系合并，数据库专业突出，是国家首批35所国家示范性软件学院之一。

- 软件学院成立于2002年，与交通大学齐名。

上海交通大学

- 软件工程学科实力强劲，拥有高可靠软件系统实验室等国家级平台，与复旦大学并列为国内顶尖高校。

同济大学

- 计算机科学与技术学院是国家“双一流”“211工程”“985工程”重点建设高校，软件工程领域排名全国第三。

二、特色鲜明的高校

华东师范大学：

计算机科学与技术系入选中国最好学科，软件工程专业在市内排名领先。

上海交通大学软件学院：国家级示范性软件学院，专注高可靠软件系统开发。

上海应用技术大学：软件工程为省级重点专业，注重工程实践能力培养。

三、民办及独立学院

上海建桥学院：民办高校，软件工程专业注重实践创新，培养应用型人才。

东华大学：软件工程专业特色鲜明，与交通大学、同济大学形成竞争。

上海杉达学院：独立学院，计算机科学与技术专业实力较强。

四、其他相关院校

上海电力大学：市内高校中软件工程实力突出。

上海电机学院：工科特色鲜明，软件工程与电力系统结合紧密。

总结

上海软件工程专业覆盖多所层次高校，从综合性顶尖大学到特色鲜明的高校，形成多元化发展格局。选择时可根据具体需求（如学术资源、行业认可度、实践机会等）进行综合考量。