根据金庸小说《射雕英雄传》的设定，东邪、西毒、南帝、北丐、中神通的武功排名顺序如下：

一、中神通王重阳

全真教创始人，武功天下第一，以先天功、金雁功、全真剑法为核心，兼修一阳指（克制欧阳锋蛤蟆功）。其内力深厚，招式精妙，是公认的五绝之首。

二、北丐洪七公

丐帮帮主，降龙十八掌与打狗棒法威震江湖，逍遥游掌法融合《九阴真经》武学。其武功刚猛实用，实战能力与欧阳锋不相上下，但内力稍逊于王重阳。

三、东邪黄药师

桃花岛主，弹指神通、玉箫剑法独步江湖，精通医术与奇门遁甲。虽未在第一次华山论剑中夺冠，但综合实力仍属顶尖。

四、西毒欧阳锋

西域白驼山山主，蛤蟆功威力巨大，后逆练《九阴真经》更胜一筹。其用毒与逆转经脉的武功极具特色，但依赖性较强。

五、南帝段智兴

大理国皇帝，一阳指与先天功结合，兼具慈悲与武学造诣。虽为出家人，但武功与中原四绝旗鼓相当。

总结：排名综合了各绝技特点与小说情节，中神通王重阳因内力与招式全面性稳居第一，北丐洪七公的实战能力紧随其后，其他四绝各具特色但存在短板。