DNASTAR 是由 DNASTAR 公司开发的一套综合性生物信息学分析软件套件,包含多个功能模块,主要用于 DNA 和蛋白质序列分析、基因组学研究及分子生物学应用。根据不同的版本和组件,DNASTAR 包含以下主要软件模块:
一、核心分析模块
SeqMan II 提供序列编辑、格式转换、拼接、重叠群处理等功能,支持构建系统进化树。
包含子序列比对、基因寻找、蛋白质结构域预测等工具。
GeneQuest
用于小至 BAC 质粒、大至基因组序列的基因、图谱及特征标注。
支持基于序列相似性的布尔查询,辅助基因预测。
Protean
预测蛋白质二级结构,识别抗原区域,辅助蛋白质功能分析。
基于 Protean 3D 和 NovaFold 模型,可预测蛋白质三维结构。
MegAlign
支持配对和多重序列比对,构建系统发育树,分析序列相似性。
提供序列编辑和可视化工具,便于结果解读。
PrimerSelect
设计 PCR、测序、测序引物及探针,支持参数优化和结果筛选。
MapDraw
生成限制图谱,标注位点、翻译框及特征,辅助基因克隆设计。
EditSeq
导入外部序列文件,与其他工具集成分析。
二、扩展功能模块
SeqMan Pro
支持序列聚类、SNP(单核苷酸多态性)检测及功能注释。
Primer Premier
提供高级引物设计功能,包含多种算法和结果存储格式。
Vector NTI Suite
除 DNASTAR 模块外,还包含 RNA 分析、质粒设计等工具。
三、其他相关工具
Lasergene Cloning Suite: 支持序列编辑、克隆方法(如 Gateway Multisite、TA、TOPO)及虚拟克隆。 SeqNinja
GenVision:提供基因组可视化功能。
四、其他版本说明
旧版本(如 Lasergene v7.1)包含类似模块,但部分功能可能已更新或整合到新版本中。
NGS 特定工具(如 Genomics 模块)针对下一代测序数据优化,支持快速组装和比对。
以上模块共同构成 DNASTAR 的核心功能体系,覆盖从基础分析到复杂研究的多样化需求。