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测序软件有哪些

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测序软件种类繁多,根据不同的测序平台和数据类型,可以选择合适的软件来进行分析。以下是一些常用的测序软件:

Parabricks:

由英伟达GPU驱动的基因组测序软件,能够将基因组分析效率从几天时间提升至一个小时内。

DRAGEN:

由因美纳(Illumina)推出的最新版本的软件,用于分析新一代测序数据,改进了遗传病病因变异的鉴定、药物发现和群体基因组学相关的分析流程。

DNASTAR:

提供新一代软件解决方案,用于个人基因组及个性化医疗。

PaSER Novor:

基于Rapid Novor自主研发的Novor算法,使用timsTOF质谱平台上超过170万个PSM作为训练集,对Novor算法进行了重新训练和优化。

ANGSD:

用于低深度重测序分析的全面软件包。

BWA (Burrows-Wheeler Aligner):

用于Illumina等平台产生的短序列读段的比对软件。

PEAKS Studio:

由蛋白质测序领域最前沿的科学家马斌主持开发的蛋白组学商业软件。

UCS (Universal Copy Service):

因美纳公司推出的测序仪软件组件,用于修复软件网络安全风险隐患。

SCRuB:

一种高精度去污方法,用于微生物组数据分析。

这些软件涵盖了从基因组学、蛋白组学到微生物组学等多个领域,用户可以根据具体的研究需求和测序平台选择合适的软件工具。