一、生物催化设计与优化工具

INSIGHT平台

澳门理工大学生命科学研究院开发，用于提升NAD（P）H-依赖型酶辅因子的特异性预测，通过深度学习和蛋白质语言模型提高筛选效率。

Scaffold-Mediated Assembly Regulation Tool （SMART）

用于动态控制多酶生物催化剂在谷氨酸棒杆菌表面的组装，实现精准调控。

二、基因与蛋白质分析工具

智能算法与AI辅助工具

如搜狐简单AI等平台，支持基因序列设计、文献检索与分析，加速酶类创新。

蛋白质建模与分析软件

- HyperChem：

涵盖药物设计、蛋白质折叠、配体对接等，适用于分子动力学模拟和酶动力学研究。

- ChIME：浏览器端3D分子可视化工具，便于快速查看蛋白质结构。

三、实验设计与高通量筛选工具

高通量筛选平台

与深圳智峪生物科技有限公司合作开发的平台，结合AI技术优化酶辅因子筛选流程。

动态调控工具

通过可编程支架实现多酶组合的动态调控，提升实验效率。

四、文献与数据管理工具

文献检索平台

如知网、PubMed等，支持快速获取生物催化相关研究资料。

数据记录与管理工具

- 拾菌：

用于真菌类样本数据记录。

注：部分工具如HyperChem、RASMOL等虽未直接提及生物催化，但广泛应用于相关领域的基础研究。建议根据具体研究需求选择专业工具，并结合AI辅助平台提升效率。