一、专业化学绘图软件

ChemDraw

- 由PerkinElmer开发，功能全面，支持复杂结构绘制、反应式编辑及3D可视化，是化学领域权威工具。

- 优势：集成性强，与量子化学软件（如Chem3D）结合使用，适合药物研发和学术研究。

MarvinSketch

- 专注于分子结构绘制，支持快速生成结构式，且免费使用。适合需要高效绘图的用户。

- 特点：界面简洁，适合教学和科研场景。

KingDraw

- 支持Linux、macOS及移动平台，提供免费版本，移动端移植性良好。适合需要跨平台使用的用户。

二、国产优秀软件

inDraw

- 国产分子结构绘制工具，注册后免费使用，支持快速识别和绘制复杂结构，适合国内用户。

Img2Chem

- 通过图片识别生成化学结构式，适合需要批量处理结构数据的用户。

三、学术与科研专用工具

UCSF Chimera

- 用于生物大分子（如蛋白质、核酸）的三维可视化，支持插件扩展，适合结构生物学家。

Jmol

- 基于Java的网页交互式工具，适合教学和基础研究，操作简单。

四、其他工具

亿图分子模型图设计软件：

支持一键编辑分子结构，适合需要动态展示的用户。

Chemical Identifier Resolver （CIR）：用于化学物质查询和结构绘制，适合文献调研。

五、选择建议

学术/工业研究：优先考虑ChemDraw、Chimera等成熟工具，结合QuantumChem等后端分析软件使用。

教学需求：MarvinSketch、KingDraw等免费工具性价比高，支持快速学习。

移动端绘图：KingDraw、Jmol等提供移动版本，适合随时随地进行初步结构设计。

以上工具可根据具体需求组合使用，例如先用MarvinSketch快速生成结构，再导入ChemDraw进行精细编辑。