一、高通量脱靶检测平台

GUIDE-Seq系列

- 功能：

结合脱靶检测与高通量筛选，评估sgRNA的切割效率和脱靶效应，适用于基因编辑研究。

- 特点：由珠海舒桐医疗科技有限公司开发，是CRISPR-Cas9研究中的重要工具。

Cas9在线自动化设计及脱靶评估系统

- 功能：

提供Cas9靶点设计及脱靶预测服务，支持自动化流程。

- 状态：目前提供试运行版，用户需注意信息安全和产品资质验证。

二、数据分析工具

CRISPResso2

- 功能：

用于分析脱靶外显子组数据，检测拷贝数变异（CNV）、纯合区域及共享单倍型。

- 应用场景：常与脱靶检测数据结合使用，辅助解读编辑结果。

circularCnv

- 功能：

检测环形DNA结构，辅助识别脱靶导致的基因结构变异。

三、其他辅助工具

CT-Finder：用于无人机位置追踪，通过图像识别技术计算脱靶量（需注意该信息来自非专业生物领域）。

CNVOffSeq：开源工具，用于分析脱靶外显子组数据中的CNV，并进行基因分型。

四、注意事项

数据预处理：脱靶分析通常需结合测序数据预处理（如比对、质量过滤），建议使用如`HISAT2`、`SPAdes`等工具。

参数调整：部分工具（如CRISPResso2）支持参数配置，需根据实验设计优化敏感度。

以上工具覆盖了从脱靶检测到结果分析的全流程，可根据具体需求选择组合使用。