南京作为中国软件产业的重要城市，拥有众多民营软件企业，涵盖企业管理、工业软件、轨道交通等领域。以下是部分代表性企业及分类整理：

一、领先企业

金蝶软件

中国领先的企业管理软件及云服务提供商，产品涵盖财务、供应链、生产、人力资源等全领域，K/3 WISE和EAS是核心ERP系统。

用友网络

另一家知名ERP厂商，U8、NC和YonSuite系统广受中小企业青睐，以易用性和高性价比著称。

东大金智

专注于电力系统自动化与信息化解决方案，提供软件研发与电力设备集成服务。

二、新兴与特色企业

诚迈科技

专注操作系统研发，产品应用于消费电子、智能汽车等领域，合作客户包括世界500强企业。

翼辉信息技术

开发自主实时操作系统SylixOS，内核代码自主率达100%，推动国产化替代。

南瑞继保

电力系统自动化软件与硬件制造商，软件部分具有较强竞争力。

三、其他知名企业

中电科信：

南京中电科技股份有限公司旗下企业，涉及智能电网、物联网等领域。

东软集团：虽为跨国企业，但南京设有研发中心，涉及医疗、金融等领域。

浪潮信息：服务器与云计算解决方案提供商，南京为其重要基地。

四、细分领域代表

轨道交通：南京欣网通信科技股份有限公司（2006年成立），专注通信与信息系统服务。

工业软件：如翼辉信息开发的SylixOS，覆盖汽车电子、工业控制等场景。

总结

南京民营软件企业数量庞大且覆盖领域广泛，既有金蝶、用友等龙头企业，也有专注于细分市场的新兴企业。建议根据具体需求（如行业领域、技术方向）进一步筛选。