制药工程涉及多个领域的专业软件，涵盖设计、分析、生产管理及设备维护等环节。以下是主要分类及常用软件的总结：

一、核心设计类软件

工程制图与分子设计

- ChemDraw：

用于绘制化学分子结构式、反应机理图等

- CAD/SolidWorks：辅助绘制制药车间平面图、设备布局等工程图纸

- GROMACS/AMBER/CHARMM：分子动力学模拟软件，用于蛋白质、药物分子等生物大分子的结构分析

工艺设计与优化

- Aspen Plus：

化工及制药行业主流流程模拟软件，支持反应器设计、能量平衡及工艺优化

- COMSOL Multiphysics：多物理场仿真工具，用于模拟热传递、流体流动等复杂过程

- gPROMS：专注于制药工艺模拟，提供配方优化建议

二、数据分析与统计类

统计分析工具

- SPSS/R：

基础统计分析及可视化，适用于临床试验数据、工艺优化分析

- MATLAB：集成数值计算、数据分析及图形绘制功能，适合工程计算与建模

- Origin：专业数据分析和图形展示软件，常用于实验结果可视化

实验数据处理

- Minitab：

易用性强的统计分析软件，适合质量控制和工艺改进

- GraphPad Prism：生物医学研究专用统计软件，处理生物实验数据及图表绘制

三、生产管理类

设备与物料管理

- EAM/CMS：

企业资产管理及维护管理系统，支持设备台账、维修计划及备件库存管理

- 建米软件：专注制药设备管理，提供设备全生命周期追踪及能源优化功能

质量与合规管理

- QMS：

质量管理系统，确保药品生产符合GMP等法规要求

- LIMS：实验室信息管理系统，实现样品管理、数据追溯及流程控制

四、项目管理类

Microsoft Project/Trello/Asana：项目进度跟踪、资源分配及团队协作工具，支持与Office的无缝集成

五、其他辅助工具

Python/Ruby：编程语言，配合NumPy、Pandas等库进行数据处理、机器学习及自动化脚本开发

文献管理软件：如EndNote、Zotero，用于学术论文资料整理

以上软件可根据具体需求组合使用，例如用MATLAB进行模拟分析，结合Aspen Plus优化工艺，再通过SPSS验证结果。制药工程领域软件选择需兼顾专业性和行业规范，建议根据实际工作流程逐步引入。