一、常用软件推荐
ImageJ - 功能:
免费开源的图像处理软件,支持灰度分析、条带选取、面积计算及多组数据对比。
- 适用场景:基础条带定量、背景校正及多通道数据分析。
Quantity One - 功能:
专业WB分析软件,可精确计算条带分子量,对实验条件要求严格。
- 适用场景:分子量校准、复杂样品分析及多组数据同步处理。
Gel-Pro Analyzer - 功能:
专门针对WB实验的灰度扫描分析工具,支持自动峰值识别和面积计算。
- 适用场景:高效处理多条带数据,减少手动操作误差。
二、操作步骤与技巧
1. 数据获取与预处理
图像导入:使用软件(如ImageJ)打开WB条带图,必要时转换为灰度图(`Image → Type → 8-bit`)。
背景校正:通过`Process → Subtract Background`或手动选取背景区域扣除。
泳道与条带校正:手动或自动检测泳道,确保条带居中且宽度一致。
2. 条带定量分析
手动分析:使用矩形工具圈选条带区域,通过魔棒工具闭合峰值区域,计算面积(`Analyze → Gels → Plot Lanes`)。
自动分析:部分软件(如Image Lab)支持自动识别泳道和条带,直接生成定量结果。
相对/绝对定量:
相对定量:以内参蛋白(如GAPDH)为基准,计算条带面积比;
绝对定量:通过标准曲线拟合计算未知蛋白浓度。
3. 结果处理与可视化
数据导出:可导出原始图像、柱状图、3D热图等多种格式;
多组对比:通过叠加柱状图或热图直观展示实验组与对照组差异;
归一化处理:使用内参蛋白进行归一化,消除样本间加载量差异。
三、注意事项
实验标准化:
内参蛋白选择需稳定,电泳条件需重复性好;
软件校准:
使用`Analyze → Calibrate`进行亮度校准,确保数据准确性;
结果验证:
可结合质谱或免疫荧光结果交叉验证。
通过以上工具与方法,可高效完成WB条带分析,提升实验效率与数据可靠性。